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Enregistrement W1983910372 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-623

Abstract 623: The PARP3- and ATM-dependent phosphorylation of APLF facilitates DNA double-strand break repair.

2013· article· en· W1983910372 sur OpenAlexaff
Christine A. Koch, Amanda L. Fenton, Purnata Shirodkar, Meng Li

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphorylationDNA damageSerineDNA repairDNAPoly ADP ribose polymeraseCancer cellCell biologyChemistryMolecular biologyCancerBiologyCancer researchBiochemistryGeneticsPolymerase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract APLF is a forkhead associated (FHA)-containing protein with poly(ADP-ribose)-binding zinc finger (PBZ) domains, which undergoes ionizing radiaiton (IR)-induced and ATM-dependent phosphorylation at serine-116 (Ser116). Here we demonstrate that the phosphorylation of APLF at Ser116 in human U2OS cells by ATM is dependent on PARP3 levels and the APLF PBZ domains. The interaction of APLF at sites of DNA damage was diminished by the single substitution of APLF Ser116 to alanine, and the cellular depletion or chemical inhibition of ATM or PARP3 also altered the retention of APLF at sites of laser-induced DNA damage, and impaired the accumulation of Ser116-phosphorylated APLF at IR-induced γH2AX foci in human cells. The data further suggest that ATM and PARP3 participate in a common signaling pathway to facilitate APLF-Ser116 phosphorylation, which, in turn, appears to be required for efficient DNA double-strand break (DSB) repair kinetics and cell survival following IR. Collectively, these findings provide a more detailed understanding of the molecular pathway that leads to the phosphorylation of APLF following DNA damage, and suggest that Ser116-APLF phosphorylation facilitates APLF-dependent DSB repair. Citation Format: Christine A. Koch, Amanda L. Fenton, Purnata Shirodkar, Li Meng. The PARP3- and ATM-dependent phosphorylation of APLF facilitates DNA double-strand break repair. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 623. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-623

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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