The mechanism of ABC transporters: general lessons from structural and functional studies of an antigenic peptide transporter
Notice bibliographique
Résumé
The shuttling of substrates across a cellular membrane frequently requires a specialized ATP‐ binding cassette (ABC) transporter, which couples the energy of ATP binding and hydrolysis to substrate transport. Due to its importance in immunity, the ABC transporter associated with antigen processing (TAP) has been studied extensively and is an excellent model for other ABC transporters. The TAP protein pumps cytosolic peptides into the endoplasmic reticulum for loading onto class I major histocompatibility complex (MHC) for subsequent immune surveillance. Here, we outline a potential mechanism for the TAP protein with supporting evidence from bacterial transporter structures. The similarities and differences between TAP and other transporters support the notion that ABC transporters in general have adapted around a universal transport mechanism.— Procko, E., O'Mara, M. L., Bennett, W. F. D., Tieleman, D. P., Gaudet, R. The mechanism of ABC transporters: general lessons from structural and functional studies of an antigenic peptide transporter. FASEBJ. 23, 1287–1302 (2009)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».