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Enregistrement W1984383126 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-1977

Abstract 1977: The protein phosphatase 2 subunit PR48 is a novel melanoma tumor suppressor gene.

2013· article· en· W1984383126 sur OpenAlexaff
Léon CL van Kempen, Jonathan Jarry, Mounib Elchebly, Margaret Redpath, Per‐Henrik Edqvist, Fredrik Pontén, Richard A. Scolyer, Dirk Schadendorf, Celia M.T. Greenwood, Joost van den Oord, Alan Spatz

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensConcordia UniversityMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMelanomaCell cycleBiologyCancer researchEctopic expressionSmall hairpin RNATumor progressionCell growthProtein subunitCancerTumor suppressor geneMetastasisCell cultureMolecular biologyCarcinogenesisGeneGeneticsGene knockdown

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cutaneous melanoma cell proliferation is a strong prognostic factor for distant metastasis free survival (DMFS). In the current study we tested if aberrant expression of a regulator both DNA replication and cell cycle progression, i.e. the protein phosphatase 2A subunit PR48, could be a driver of melanoma proliferation and progression. Quantitative analysis of PR48 mRNA expression revealed a strong correlation between low levels of expression and poor DMFS in a multivariate analysis (n=49, p=0.0007). In line with this, no or low PR48 protein expression was associated with poor overall survival in three independent samples sets of melanoma (n=339, P<0.001), and reduced PR48 expression correlated with increased proliferation (P=0.0023). Functional analysis using over expression and knock down strategies in melanoma cell lines demonstrated that PR48 alters cdc6-cdt1 complex formation, regulates pRb phosphorylation status, and entry into the S-phase of the cycle progression. Ectopic PR48 expression decreased tumorigenicity of melanoma cells, and shRNA-mediated reduced PR48 expression increased tumor take and growth in nude mice. Our data demonstrate that PPP2R3B is a novel tumor suppressor gene in melanoma, whose loss of expression contributes increased proliferation and poor survival. Citation Format: Léon CL van Kempen, Jonathan Jarry, Mounib Elchebly, Margaret Redpath, Per-Henrík Edqvist, Fredrik Pontén, Richard Scolyer, Dirk Schadendorf, Celia M.T. Greenwood, Joost van den Oord, Alan Spatz. The protein phosphatase 2 subunit PR48 is a novel melanoma tumor suppressor gene. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 1977. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-1977

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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