Abstract 1977: The protein phosphatase 2 subunit PR48 is a novel melanoma tumor suppressor gene.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cutaneous melanoma cell proliferation is a strong prognostic factor for distant metastasis free survival (DMFS). In the current study we tested if aberrant expression of a regulator both DNA replication and cell cycle progression, i.e. the protein phosphatase 2A subunit PR48, could be a driver of melanoma proliferation and progression. Quantitative analysis of PR48 mRNA expression revealed a strong correlation between low levels of expression and poor DMFS in a multivariate analysis (n=49, p=0.0007). In line with this, no or low PR48 protein expression was associated with poor overall survival in three independent samples sets of melanoma (n=339, P<0.001), and reduced PR48 expression correlated with increased proliferation (P=0.0023). Functional analysis using over expression and knock down strategies in melanoma cell lines demonstrated that PR48 alters cdc6-cdt1 complex formation, regulates pRb phosphorylation status, and entry into the S-phase of the cycle progression. Ectopic PR48 expression decreased tumorigenicity of melanoma cells, and shRNA-mediated reduced PR48 expression increased tumor take and growth in nude mice. Our data demonstrate that PPP2R3B is a novel tumor suppressor gene in melanoma, whose loss of expression contributes increased proliferation and poor survival. Citation Format: Léon CL van Kempen, Jonathan Jarry, Mounib Elchebly, Margaret Redpath, Per-Henrík Edqvist, Fredrik Pontén, Richard Scolyer, Dirk Schadendorf, Celia M.T. Greenwood, Joost van den Oord, Alan Spatz. The protein phosphatase 2 subunit PR48 is a novel melanoma tumor suppressor gene. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 1977. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-1977
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».