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Enregistrement W1984391626 · doi:10.1158/1078-0432.tcmusa10-a11

Abstract A11: Regulation of CD133 by the tubulin deacetylase HDAC6 can alter cancer cell state

2010· article· en· W1984391626 sur OpenAlexaff
Anthony B. Mak, Saranya Kittanakom, Ginny I. Chen, Ralph Mazitschek, Anne‐Claude Gingras, Igor Štagljar, Jason Moffat

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHDAC6Cell biologyProgenitor cellCancer researchAcetylationStem cellHistone deacetylaseMolecular biologyHistoneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The CD133 antigen AC133/1 is a putative marker for enriching certain stem cells and cancer progenitor cells. Despite its wide application, the function and regulation of its expression remains unclear. Given the presence of its transcript in more differentiated cells, epigenetic regulation of CD133 transcripts alone cannot vouch for its utility as a marker. Therefore, understanding the regulation of CD133 protein expression is important for further defining the cellular state of tumor-initiating cells. We used the MAPLE system (Mak et al, Mol Cell Proteomics, 2010) to identify bona fide protein interaction partners of CD133. We present the microtubule-associated histone deacetylase 6 (HDAC6) as a physical interaction partner of CD133. This interaction was validated by co-immunoprecipitation/Western Blot analyses and by a membrane yeast two-hybrid (MYTH) assay. In order to understand the functional consequence of the HDAC6 and CD133 interaction, we used lentiviral short-hairpin RNAs to knockdown HDAC6 in multiple cell types, including the human epithelial colorectal adenocarcinoma lines Caco- 2 and HT-29 and in the retinoblastoma cell line Weri-Rb-1. Interestingly, we observed a significant reduction of CD133 protein expression. This reduction was shown to be dependent on HDAC6 deacetylase activity using a deacetlyase deficient HDAC6 mutant as well as when using the small molecule inhibitor of HDAC6, tubacin. HDAC6 promotes de-acetylation of alpha-tubulin to influence re-cycling of cell surface proteins. Furthermore, when we performed a CD133 MYTH screen against a cDNA library isolated from an adult human brain, we identified the late endosomal- and lysosomal-associated marker CD63 as an interaction partner of CD133. In fact, treatment of Caco-2 cells with tubacin resulted in trafficking of CD133 into endosomes for lysosomal degradation as determined by increased co-localization with CD63. In an attempt to study the affect of HDAC6 knockdown on cell viability, we noticed that CD133 knockdown significantly impacted cell proliferation and clonogenicity of Caco-2 cells. We determined that the cause of this is likely due to increased differentiation as determined by the level of alkaline phosphatase activity and by quantitative realtime PCR for markers of differentiated colon cells. To assess the tumorigenic potential of Caco-2 cells with reduced CD133 expression in vitro we performed soft agar colony-forming assay, which resulted in the loss of anchorage independent growth, a well-known hallmark of cancer. Together, these results suggest that CD133 can exercise a function in establishing and maintaining a primitive cancer cell state and loss or reduction of its expression marks more differentiated cancer cells that may be nontumorigenic. Citation Information: Clin Cancer Res 2010;16(14 Suppl):A11.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,462
Écart entre enseignants0,396 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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