The T Cell Receptor β-Chain Second Complementarity Determining Region Loop (CDR2β) Governs T Cell Activation and Vβ Specificity by Bacterial Superantigens
Notice bibliographique
Résumé
Superantigens (SAgs) are microbial toxins defined by their ability to activate T lymphocytes in a T cell receptor (TCR) β-chain variable domain (Vβ)-specific manner. Although existing structural information indicates that diverse bacterial SAgs all uniformly engage the Vβ second complementarity determining region (CDR2β) loop, the molecular rules that dictate SAg-mediated T cell activation and Vβ specificity are not fully understood. Herein we report the crystal structure of human Vβ2.1 (hVβ2.1) in complex with the toxic shock syndrome toxin-1 (TSST-1) SAg, and mutagenesis of hVβ2.1 indicates that the non-canonical length of CDR2β is a critical determinant for recognition by TSST-1 as well as the distantly related SAg streptococcal pyrogenic exotoxin C. Frame work (FR) region 3 is uniquely critical for TSST-1 function explaining the fine Vβ-specificity exhibited by this SAg. Furthermore, domain swapping experiments with SAgs, which use distinct domains to engage both CDR2β and FR3/4β revealed that the CDR2β contacts dictate T lymphocyte Vβ-specificity. These findings demonstrate that the TCR CDR2β loop is the critical determinant for functional recognition and Vβ-specificity by diverse bacterial SAgs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».