Cefotaximases (CTX-M-ases), an expanding family of extended-spectrum β-lactamases
Notice bibliographique
Résumé
Among the extended-spectrum beta-lactamases, the cefotaximases (CTX-M-ases) constitute a rapidly growing cluster of enzymes that have disseminated geographically. The CTX-M-ases, which hydrolyze cefotaxime efficiently, are mostly encoded by transferable plasmids, and the enzymes have been found predominantly in Enterobacteriaceae, most prevalently in Escherichia coli, Salmonella typhimurium, Klebsiella pneumoniae, and Proteus mirabilis. Isolates of Vibrio cholerae, Acinetobacter baumannii, and Aeromonas hydrophila encoding CTX-M-ases have also been reported. The CTX-M-ases belong to the molecular class A beta-lactamases, and the enzymes are functionally characterized as extended-spectrum beta-lactamases. This group of beta-lactamases confers resistance to penicillins, extended-spectrum cephalosporins, and monobactams, and the enzymes are inhibited by clavulanate, sulbactam, and tazobactam. Typically, the CTX-M-ases hydrolyze cefotaxime more efficiently than ceftazidime, which is reflected in substantially higher MICs to cefotaxime than to ceftazidime. Phylogenetically, the CTX-M-ases are divided into four subfamilies that seem to have descended from chromosomal beta-lactamases of Kluyvera spp. Insertion sequences, especially ISEcp1, have been found adjacent to genes encoding enzymes of all four subfamilies. The class I integron-associated orf513 also seems to be involved in the mobilization of blaCTX-M genes. This review discusses the phylogeny and the hydrolytic properties of the CTX-M-ases, as well as their geographic occurrence and mode of spread.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».