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Enregistrement W1984537277 · doi:10.1139/w00-083

The binding of<i>Proteus mirabilis</i>nonagglutinating fimbriae to ganglio-series asialoglycolipids and lactosyl ceramide

2000· article· en· W1984537277 sur OpenAlexaffvenue
Kok K Lee, Blair A. Harrison, Roger K. Latta, Eleonora Altman

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteus mirabilisMicrobiologyFimbriaMonoclonal antibodyGlycoconjugateBiologyAntibodyChemistryMolecular biologyBiochemistryEscherichia coliImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteus mirabilis is a common opportunistic Gram-negative uropathogen that infects the upper urinary tract. We have examined the role of the nonagglutinating fimbriae (NAF) of P. mirabilis in mediating bacterial adhesion to cell surface receptors. Purified NAF of P. mirabilis were demonstrated to bind to a number of glycolipids, including asialo-GM1, asialo-GM2, and lactosyl ceramide (LacCer) in solid-phase binding assays and in thin layer chromatography (TLC) overlay assays. Furthermore, preincubation of the biotinylated NAF (Bt-NAF) with anti-NAF monoclonal antibodies resulted in inhibition of NAF binding to immobilized asialo-GM1, asialo-GM2, and LacCer. In adherence assays, P. mirabilis binding to Madin-Darby canine kidney (MDCK) cells was inhibited by murine anti-asialo-GM1 monoclonal antibodies H2G10 to about 50% of the binding level in the absence of the antibody, specific for the terminal beta-galactopyranosyl residue of asialo-GM1 (Harrison et al. 1998). The results of this study suggest that NAF of P. mirabilis recognize a GalNAc beta 1-4Gal moiety present in the ganglio-series of asialoglycolipids, and that the terminal beta-galactopyranosyl-containing glycoconjugates play a role in NAF-mediated adherence of P. mirabilis to MDCK cells. Similarly to other bacteria, P. mirabilis NAF was also shown to express the LacCer specificity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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