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Enregistrement W1984565472 · doi:10.1074/jbc.m209588200

Acute Phase Mediators Modulate Thrombin-activable Fibrinolysis Inhibitor (TAFI) Gene Expression in HepG2 Cells

2003· article· en· W1984565472 sur OpenAlexafffund
Michael B. Boffa, Jeffrey D. Hamill, Deborah Maret, Darryl K. Brown, Michelle L. Scott, Michael E. Nesheim, Marlys L. Koschinsky

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensKingston Health Sciences CentreQueen's University
Organismes subventionnairesUniversity of Ottawa
Mots-clésFibrinolysisThrombinThrombin generationGene expressionChemistryPharmacologyGeneCell biologyMedicineBiologyInternal medicineBiochemistryPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thrombin-activable fibrinolysis inhibitor (TAFI) has recently been identified as a positive acute phase protein in mice, an observation that may have important implications for the interaction of the coagulation, fibrinolytic, and inflammatory systems. Activated TAFI (TAFIa) inhibits fibrinolysis by removing the carboxyl-terminal lysines from partially degraded fibrin that are important for maximally efficient plasminogen activation. In addition, TAFIa has been shown to be capable of removing the carboxyl-terminal arginine residues from the anaphylatoxins and bradykinin, thus implying a role for the TAFI pathway in the vascular responses to inflammation. In the current study, we investigated the ability of acute phase mediators to modulate human TAFI gene expression in cultured human hepatoma (HepG2) cells. Surprisingly, we found that treatment of HepG2 cells with a combination of interleukin (IL)-1 and IL-6 suppressed endogenous TAFI mRNA abundance in HepG2 cells (~60% decrease), while treatment with IL-1 or IL-6 alone had no effect. Treatment with IL-1 and/or IL-6 had no effect on TAFI promoter activity as measured using a luciferase reporter plasmid containing the human TAFI 5'-flanking region, whereas treatment with IL-1 and IL-6 in combination, but not alone, decreased the stability of the endogenous TAFI mRNA. Treatment with the synthetic glucocorticoid dexamethasone resulted in a 2-fold increase of both TAFI mRNA levels and promoter activity. We identified a functional glucocorticoid response element (GRE) in the human TAFI promoter between nucleotides 92 and 78. The GRE was capable of binding the glucocorticoid receptor, as assessed by gel mobility shift assays, and mutation of this element markedly decreased the ability of the TAFI promoter to be activated by dexamethasone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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