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Enregistrement W1984651643 · doi:10.1021/bi000473i

Interaction of Cardiac Troponin C with Ca<sup>2+</sup> Sensitizer EMD 57033 and Cardiac Troponin I Inhibitory Peptide

2000· article· en· W1984651643 sur OpenAlexaff
Monica X. Li, Leo Spyracopoulos, Norbert Beier, John A. Putkey, Brian D. Sykes

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTroponin complexTroponin IBiophysicsTroponin CHeteronuclear single quantum coherence spectroscopyBinding siteContractilityHelix (gastropod)Cardiac muscleBiochemistryStereochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyInternal medicineBiologyEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The binding of Ca(2+) to cardiac troponin C (cTnC) triggers contraction in cardiac muscle. In diseased heart, the myocardium is often desensitized to Ca(2+), leading to weak cardiac contractility. Compounds that can sensitize cardiac muscle to Ca(2+) would have potential therapeutic value in treating heart failure. The thiadiazinone derivative EMD 57033 is an identified 'Ca(2+) sensitizer', and cTnC is a potential target of the drug. In this work, we used 2D ¿(1)H, (15)N¿-HSQC NMR spectroscopy to monitor the binding of EMD 57033 to cTnC in the Ca(2+)-saturated state. By mapping the chemical shift changes to the structure of cTnC, EMD 57033 is found to bind to the C-domain of cTnC. To test whether EMD 57033 competes with cardiac TnI (cTnI) for cTnC and interferes with the inhibitory function, we examined the interaction of cTnC with an inhibitory cTnI peptide (residues 128-147, cIp) in the absence and presence of EMD 57033, respectively. cTnC was also titrated with EMD 57033 in the presence of cIp. The results show that although both the drug and cIp interact with the C-domain of cTnC, they do not displace each other, suggesting noncompetitive binding sites for the two targets. Detailed chemical shift mapping of the binding sites reveals that the regions encompassing helix G-loop IV-helix H are more affected by EMD 57033, while residues located on helix E-loop III-helix F and the linker between sites III and IV are more affected by cIp. In both cases, the binding stoichiometry is 1:1. The binding affinities for the drug are 8.0 +/- 1.8 and 7.4 +/- 4.8 microM in the absence and presence of cIp, respectively, while those for the peptide are 78.2 +/- 10.3 and 99.2 +/- 30.0 microM in the absence and presence of EMD 57033, respectively. These findings suggest that EMD 57033 may exert its positive inotropic effect by not directly enhancing Ca(2+) binding to the Ca(2+) regulatory site of cTnC, but by binding to the structural domain of cTnC, modulating the interaction between cTnC and other thin filament proteins, and increasing the apparent Ca(2+) sensitivity of the contractile system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,947

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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