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Enregistrement W1984726732 · doi:10.1038/tp.2012.89

Meta-analysis of genome-wide association studies for panic disorder in the Japanese population

2012· review· en· W1984726732 sur OpenAlex
Takeshi Otowa, Yuta Kawamura, Nao Nishida, Nagisa Sugaya, Atsushi Koike, Eiji Yoshida, Ken Inoue, Shin Yasuda, Yukika Nishimura, Xiaoxi Liu, Y. Konishi, Fumichika Nishimura, Takafumi Shimada, Hitoshi Kuwabara, Mamoru Tochigi, Chihiro Kakiuchi, Tadashi Umekage, Taku Miyagawa, Akinori Miyashita, Eiji Shimizu, Jotaro Akiyoshi, Toshiyuki Someya, Tadafumi Kato, Takeo Yoshikawa, Ryozo Kuwano, Kiyoto Kasai, Nobuo Kato, Hisanobu Kaiya, Katsushi Tokunaga, Yozo Okazaki, Hisashi Tanii, T. Sasaki

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensSTART Clinic
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceUniversity of TokyoMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyVirginia Commonwealth University
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismPanic disorderGenetic associationGeneticsBiologySNPCandidate genePopulationOdds ratioGenotypeGeneMedicineAnxietyInternal medicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Panic disorder (PD) is a moderately heritable anxiety disorder whose pathogenesis is not well understood. Due to the lack of power in previous association studies, genes that are truly associated with PD might not be detected. In this study, we conducted a genome-wide association study (GWAS) in two independent data sets using the Affymetrix Mapping 500K Array or Genome-Wide Human SNP Array 6.0. We obtained imputed genotypes for each GWAS and performed a meta-analysis of two GWAS data sets (718 cases and 1717 controls). For follow-up, 12 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were tested in 329 cases and 861 controls. Gene ontology enrichment and candidate gene analyses were conducted using the GWAS or meta-analysis results. We also applied the polygenic score analysis to our two GWAS samples to test the hypothesis of polygenic components contributing to PD. Although genome-wide significant SNPs were not detected in either of the GWAS nor the meta-analysis, suggestive associations were observed in several loci such as BDKRB2 (P=1.3 × 10(-5), odds ratio=1.31). Among previous candidate genes, supportive evidence for association of NPY5R with PD was obtained (gene-wise corrected P=6.4 × 10(-4)). Polygenic scores calculated from weakly associated SNPs (P<0.3 and 0.4) in the discovery sample were significantly associated with PD status in the target sample in both directions (sample I to sample II and vice versa) (P<0.05). Our findings suggest that large sets of common variants of small effects collectively account for risk of PD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,377
Score d'incertitude au seuil0,741

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,136
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle