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Enregistrement W1984763125 · doi:10.1073/pnas.0509950103

The molecular basis for differential dioxin sensitivity in birds: Role of the aryl hydrocarbon receptor

2006· article· en· W1984763125 sur OpenAlexaff
Sibel I. Karchner, Diana G. Franks, Sean W. Kennedy, Mark E. Hahn

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueToxic Organic Pollutants Impact
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesU.S. Department of Commerce
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorChemistryTernTransactivationReceptorSternaTranscription factorBiophysicsBiologyBiochemistryStereochemistryGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) and related halogenated aromatic hydrocarbons (HAHs) are highly toxic to most vertebrate animals, but there are dramatic differences in sensitivity among species and strains. Aquatic birds including the common tern (Sterna hirundo) are highly exposed to HAHs in the environment, but are up to 250-fold less sensitive to these compounds than the typical avian model, the domestic chicken (Gallus gallus). The mechanism of HAH toxicity involves altered gene expression subsequent to activation of the aryl hydrocarbon receptor (AHR), a basic helix-loop-helix-PAS transcription factor. AHR polymorphisms underlie mouse strain differences in sensitivity to HAHs and polynuclear aromatic hydrocarbons, but the role of the AHR in species differences in HAH sensitivity is not well understood. Here, we show that although chicken and tern AHRs both exhibit specific binding of [3H]TCDD, the tern AHR has a lower binding affinity and exhibits a reduced ability to support TCDD-dependent transactivation as compared to AHRs from chicken or mouse. We further show through use of chimeric AHR proteins and site-directed mutagenesis that the difference between the chicken and tern AHRs resides in the ligand-binding domain and that two amino acids (Val-325 and Ala-381) are responsible for the reduced activity of the tern AHR. Other avian species with reduced sensitivity to HAHs also possess these residues. These studies provide a molecular understanding of species differences in sensitivity to dioxin-like compounds and suggest an approach to using the AHR as a marker of dioxin susceptibility in wildlife.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations208
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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