TRACING THE ORIGIN OF MULTI‐DRUG RESISTANT (MDR) ESCHERICHIA COLI INFECTIONS FROM URINARY CATHETERS IN ICU CANINE PATIENTS
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Urinary tract infections (UTIs) in dogs with urinary catheters in intensive care units (ICUs) are frequent. Historically, multi‐drug resistant (MDR) Escherichia coli account for about 10% of the UTIs. The objectives of this study were to determine the frequency of E. coli infections and of MDR E. coli in dogs with UTIs in our ICU, and to assess whether the MDR E. coli were community‐acquired or nosocomial in origin. Methods: Over a 1‐year period, rectal swabs were taken from all dogs in the ICU on the day of admission (D0) and on days 3 (D3), 6 (D6), 9 (D9) and 12 (D12). Urine was collected on these days from dogs with an indwelling urinary catheter (n=190). Rectal swabs and urine were routinely cultured. E. coli isolates were identified by biochemical tests. Using NCCLS guidelines, antibiotic susceptibility testing was done by disk diffusion method on fecal and urinary E. coli isolates. Twelve antimicrobial agents were used: nalidixic acid, enrofloxacin, cephalothin, cefoxitin, cefotaxime, ceftiofur, trimethoprim‐sulfa, chloramphenicol, gentamicin, tetracycline, ampicillin, and amoxicillin/clavulanate. Pulsed‐field gel electrophoresis (PFGE) was used to compare MDR E. coli UTI strains with fecal E. coli strains from the same patient and with MDR fecal E. coli from patients that were adjacent to, or housed in the same cages. Results: E. coli was cultured from 12 (48%) of 25 UTIs. Two of the E. coli were MDR. For one dog, PFGE showed no similarities among fecal E. coli and the urinary MDR E. coli isolates from the patient or between these isolates and fecal E. coli from a dog housed in the same kennel on the previous day. The MDR E. coli UTI was likely acquired prior to admission to the ICU, as it was present on D0. For the other dog, PFGE showed genetic similarity but not complete identity between the D3 MDR E. coli urinary isolate and the D3, D6, D9 fecal MDR isolates. This suggests that the UTI originated with the fecal E. coli. Using selective plates, fecal MDR E. coli were not found on D0. Selection of the MDR strain in the intestine by the use of antibiotics occurred while the dog was in the ICU and possibly led to the UTI. Conclusions: Multi‐drug resistant E. coli accounted for 2 of 12 E. coli UTIs in dogs in the ICU over a 1‐year period. Genotyping showed that one of the two MDR E. coli infections could possibly be of nosocomial origin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».