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Enregistrement W1984854709 · doi:10.1152/ajpgi.00418.2007

Hepatocyte nuclear factor-4α promotes differentiation of intestinal epithelial cells in a coculture system

2007· article· en· W1984854709 sur OpenAlexaff
Carine Lussier, Jean‐Philippe Babeu, Benoît A. Auclair, Nathalie Perreault, François Boudreau

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Gastrointestinal and Liver Physiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyHepatocyte nuclear factorsHepatocyte nuclear factor 4BiologyMesenchymal stem cellHepatocyteIntestinal epitheliumEpitheliumTranscription factorChemistryMolecular biologyGeneNuclear receptorBiochemistryGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Normal cellular models able to efficiently recapitulate intestinal epithelial cell differentiation in culture are not yet available. The aim of this work was to establish and genetically characterize a mesenchymal-epithelial coculture system to identify transcriptional regulators involved in this process. The deposition of rat intestinal epithelial cells on human intestinal mesenchymal cells led to the formation of clustered structures that expanded shortly after seeding. These structures were composed of polarized epithelial cells with brush borders and cell junction complexes. A rat GeneChip statistical analysis performed at different time points during this process identified hepatocyte nuclear factor-4alpha (HNF-4alpha) and hepatocyte nuclear factor-1alpha (HNF-1alpha) as being induced coincidently with the apparition of polarized epithelial structures. Stable introduction of HNF-4alpha in undifferentiated epithelial cells alone led to the rapid induction of HNF-1alpha and several intestinal-specific markers and metabolism-related genes for which mRNA was identified to be upregulated during epithelial differentiation. HNF-4alpha was capable to transactivate the calbindin 3 gene promoter, a process that was synergistically increased in the presence of HNF-1alpha. When HNF-4alpha-expressing cells were plated on mesenchymal cells, an epithelial monolayer formed rapidly with the apparition of dome structures that are characteristics of vectorial ion transport. Forced expression of HNF-1alpha alone did not result in dome structures formation. In sum, this novel coculture system functionally identified for the first time HNF-4alpha as an important modulator of intestinal epithelial differentiation and offers an innovative opportunity to investigate molecular mechanisms involved in this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,866
Score d'incertitude au seuil0,781

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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