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Enregistrement W1984934383 · doi:10.1096/fj.11-185454

Origin‐specific epigenetic program correlates with vascular bed‐specific differences in <i>Rgs5</i> expression

2011· article· en· W1984934383 sur OpenAlexaff
Hangjun Zhang, Steven Gu, Basil Al‐Sabeq, Sean K. Wang, Janet He, Alex Tam, Carlo Cifelli, Nurit Mathalone, Sam Tirgari, Shelley Boyd, Scott P. Heximer

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalHeart and Stroke FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyVascular smooth muscleEpigeneticsDNA methylationAnatomyCell biologyGene expressionEndocrinologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cells from multiple origins contribute to vascular smooth muscle cell (VSMC) development. Phenotypic heterogeneity of VSMCs is associated with their point of developmental origin; however, the mechanisms driving such differences are unknown. We here examined the mechanisms controlling vascular bed-specific differences in Rgs5 expression during development. Rgs5 levels were similar across different regions of the vasculature in neonatal animals but were >15-fold higher in descending aortas compared with carotid arteries of adult mice. Thus, vessel bed-specific changes in regulation of Rgs5 expression occurred during vessel maturation. Examination of adult Rgs5-LacZ reporter mice revealed lower Rgs5 expression in VSMCs originating from the third (carotid artery) branchial arch compared with those originating in the fourth and sixth (aortic B segment, right subclavian, and ductus arteriosus) branchial arches. Indeed, a mosaic Rgs5 expression pattern, with discreet LacZ boundaries between VSMCs derived from different developmental origins, was observed. Furthermore, Rgs5-LacZ expression was correlated with the site of VSMC origin (splanchic mesoderm ≈ local mesenchyme > somites > proepicardium > mesothelium). Surprisingly, Rgs5 reporter activity in cultured carotid artery- and descending aorta-derived cells did not recapitulate the differences observed in vivo. Consistent with a developmental origin-specific epigenetic mechanism driving the observed expression differences in vivo, the Rgs5 promoter showed increased methylation on CpG dinucleotides in carotid arteries compared with that in descending aortas in adult but not in neonatal mice. In vitro methylation of the Rgs5 promoter confirmed that its activity is sensitive to transcriptional down-regulation by CpG methylation. These data suggest that an origin-dependent epigenetic program regulates vascular bed- and maturation state-dependent regulation of VSMC-specific gene transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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