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Enregistrement W1985070581 · doi:10.1186/ar1873

Degradation of small leucine-rich repeat proteoglycans by matrix metalloprotease-13: identification of a new biglycan cleavage site

2006· article· en· W1985070581 sur OpenAlexaff
Jordi Monfort, Ginette Tardif, Pascal Reboul, François Mineau, Peter J. Roughley, Jean‐Pierre Pelletier, Johanne Martel‐Pelletier

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - CanadaUniversité de MontréalHôpital Notre-Dame
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiglycanDecorinLumicanProteoglycanChemistryCleavage (geology)AggrecanCartilageBiochemistryAggrecanaseMatrix metalloproteinaseExtracellular matrixCell biologyMolecular biologyBiologyAnatomyOsteoarthritisPathologyArticular cartilageMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A major and early feature of cartilage degeneration is proteoglycan breakdown. Matrix metalloprotease (MMP)-13 plays an important role in cartilage degradation in osteoarthritis (OA). This MMP, in addition to initiating collagen fibre cleavage, acts on several proteoglycans. One of the proteoglycan families, termed small leucine-rich proteoglycans (SLRPs), was found to be involved in collagen fibril formation/interaction, with some members playing a role in the OA process. We investigated the ability of MMP-13 to cleave members of two classes of SLRPs: biglycan and decorin; and fibromodulin and lumican. SLRPs were isolated from human normal and OA cartilage using guanidinium chloride (4 mol/l) extraction. Digestion products were examined using Western blotting. The identities of the MMP-13 degradation products of biglycan and decorin (using specific substrates) were determined following electrophoresis and microsequencing. We found that the SLRPs studied were cleaved to differing extents by human MMP-13. Although only minimal cleavage of decorin and lumican was observed, cleavage of fibromodulin and biglycan was extensive, suggesting that both molecules are preferential substrates. In contrast to biglycan, decorin and lumican, which yielded a degradation pattern similar for both normal and OA cartilage, fibromodulin had a higher level of degradation with increased cartilage damage. Microsequencing revealed a novel major cleavage site (... G177/V178) for biglycan and a potential cleavage site for decorin upon exposure to MMP-13. We showed, for the first time, that MMP-13 can degrade members from two classes of the SLRP family, and identified the site at which biglycan is cleaved by MMP-13. MMP-13 induced SLRP degradation may represent an early critical event, which may in turn affect the collagen network by exposing the MMP-13 cleavage site in this macromolecule. Awareness of SLRP degradation products, especially those of biglycan and fibromodulin, may assist in early detection of OA cartilage degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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