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Enregistrement W1985123658 · doi:10.1021/bi501250m

Distinct Properties of the Two Isoforms of CDP-Diacylglycerol Synthase

2014· article· en· W1985123658 sur OpenAlexafffund
Kenneth D’Souza, Yeun Ju Kim, Tamás Balla, Richard M. Epand

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésPhosphatidic acidDiacylglycerol kinasePhosphatidylinositolBiochemistryPhospholipidChemistryEnzymeSubstrate (aquarium)Gene isoformStereochemistryBiologySignal transductionProtein kinase CGeneMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CDP-diacylglycerol synthases (CDS) are critical enzymes that catalyze the formation of CDP-diacylglycerol (CDP-DAG) from phosphatidic acid (PA). Here we show in vitro that the two isoforms of human CDS, CDS1 and CDS2, show different acyl chain specificities for its lipid substrate. CDS2 is selective for the acyl chains at the sn-1 and sn-2 positions, the most preferred species being 1-stearoyl-2-arachidonoyl-sn-phosphatidic acid. CDS1, conversely, shows no particular substrate specificity, displaying similar activities for almost all substrates tested. Additionally, we show that inhibition of CDS2 by phosphatidylinositol is also acyl chain-dependent, with the strongest inhibition seen with the 1-stearoyl-2-arachidonoyl species. CDS1 shows no acyl chain-dependent inhibition. Both CDS1 and CDS2 are inhibited by their anionic phospholipid end products, with phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphate showing the strongest inhibition. Our results indicate that CDS1 and CDS2 could create different CDP-DAG pools that may serve to enrich different phospholipid species with specific acyl chains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,375

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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