Gene expression changes in thalamus and inferior colliculus associated with inflammation, cellular stress, metabolism and structural damage in thiamine deficiency
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Notice bibliographique
Résumé
Identification of gene expression changes that promote focal neuronal death and neurological dysfunction can further our understanding of the pathophysiology of these disease states and could lead to new pharmacological and molecular therapies. Impairment of oxidative metabolism is a pathogenetic mechanism underlying neuronal death in many chronic neurodegenerative diseases as well as in Wernicke's encephalopathy (WE), a disorder induced by thiamine deficiency (TD). To identify functional pathways that lead to neuronal damage in this disorder, we have examined gene expression changes in the vulnerable thalamus and inferior colliculus of TD rats using Affymetrix Rat Genome GeneChip analysis in combination with gene ontology and functional categorization assessment utilizing the NetAffx GO Mining Tool. Of the 15 927 transcripts analysed, 125 in thalamus and 141 in inferior colliculus were more abundantly expressed in TD rats compared with control animals. In both regions, the major functional categories of transcripts that were increased in abundance after TD were those associated with inflammation (approximately 33%), stress (approximately 20%), cell death and repair ( approximately 26%), and metabolic perturbation (approximately 19%), together constituting approximately 98% of all transcripts up-regulated. These changes occurred against a background of neuronal cell loss and reactive astro- and microgliosis in both structures. Our results indicate that (i) TD produces changes in gene expression that are consistent with the observed dysfunction and pathology, and (ii) similar alterations in expression occur in thalamus and inferior colliculus, brain regions previously considered to differ in pathology. These findings provide important new insight into processes responsible for lesion development in TD, and possibly WE.
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Prédiction distillée sur la base complète
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle