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Enregistrement W1985310751 · doi:10.1038/onc.2011.486

Transgenic IGF-IR overexpression induces mammary tumors with basal-like characteristics, whereas IGF-IR-independent mammary tumors express a claudin-low gene signature

2011· article· en· W1985310751 sur OpenAlexafffund
S. Elizabeth Franks, Craig I. Campbell, Elyse Barnett, Megan D. Siwicky, Julie Livingstone, Sean Cory, Roger A. Moorehead

Notice bibliographique

RevueOncogene · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésBiologyDownregulation and upregulationTransgeneMammary glandMammary tumorCancer researchGenetically modified mouseBasal (medicine)Breast cancerCancerEndocrinologyGeneInsulinGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular profiling has allowed a more precise classification of human cancers. With respect to breast cancer, this approach has been used to identify five subtypes; luminal A, luminal B, HER2-enriched, basal-like and claudin-low. In addition, this approach can be used to determine the type of tumor represented by particular cell lines or transgenic animal models. Therefore, this approach was utilized to classify the mammary tumors that develop in MTB-IGFIR transgenic mice. It was determined that the primary mammary tumors, which develop due to elevated expression of the type I insulin-like growth factor receptor (IGF-IR) in mammary epithelial cells, most closely resemble murine tumors with basal-like or mixed gene expression profiles and with human basal-like breast cancers. Downregulation of IGF-IR transgene in MTB-IGFIR tumor-bearing mice leads to the regression of most of the tumors, followed by tumor reappearance in some of the mice. These tumors that reappear following IGF-IR transgene downregulation do not express the IGF-IR transgene and cluster with murine mammary tumors that express a mesenchymal gene expression profile and with human claudin-low breast cancers. Therefore, IGF-IR overexpression in murine mammary epithelial cells induces mammary tumors with primarily basal-like characteristics, whereas tumors that develop following IGF-IR downregulation express a gene signature that most closely resembles human claudin-low breast tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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