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Enregistrement W1985372461 · doi:10.1074/jbc.m710110200

Identification of Integrin-α4, Rb1, and Syncytin A as Murine Placental Target Genes of the Transcription Factor GCMa/Gcm1

2008· article· en· W1985372461 sur OpenAlexfundaboutno aff
Steffen Schubert, Nicolas Lamoureux, Karin Kilian, Ludger Klein‐Hitpaß, Said Hashemolhosseini

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésTranscription factorIdentification (biology)IntegrinGeneCell biologyTranscription (linguistics)BiologyGeneticsCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the GCM (glial cells missing) transcription factor family have been shown to act as master regulators in different cells during mammalian and fly development being responsible for processes including gliogenesis, hematopoiesis, placental formation, and development of the parathyroidea. In the central nervous system of flies, several target genes for GCM have been reported, namely repo, pointed, and tramtrack. In mammals, two GCM genes are known (GCMa and GCMb), but the knowledge of their target genes is very limited. Here, we present for the first time a global approach aimed to identify GCMa target genes. We found 66 genes up-regulated and 11 genes down-regulated in GCMa-deficient chorionic tissue of mice at embryonic day 9.5. Moreover, we verified by quantitative reverse transcription-PCR all 11 down-regulated genes. The two most strongly down-regulated genes, integrin-alpha4 and retinoblastoma (Rb1), were further analyzed by promoter studies. Additionally, we identified down-regulation of the murine syncytin A gene, which is fundamental for syncytiotrophoblast formation. Finally, we proved strong down-regulation of integrin-alpha4 and Rb1 transcript levels by in situ hybridization in murine GCMa-deficient placentae at embryonic day 9.5. Our data demonstrate for the first time that genes encoding key regulators of placental tissue formation and architecture are regulated by GCMa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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