Identification of Integrin-α4, Rb1, and Syncytin A as Murine Placental Target Genes of the Transcription Factor GCMa/Gcm1
Notice bibliographique
Résumé
Members of the GCM (glial cells missing) transcription factor family have been shown to act as master regulators in different cells during mammalian and fly development being responsible for processes including gliogenesis, hematopoiesis, placental formation, and development of the parathyroidea. In the central nervous system of flies, several target genes for GCM have been reported, namely repo, pointed, and tramtrack. In mammals, two GCM genes are known (GCMa and GCMb), but the knowledge of their target genes is very limited. Here, we present for the first time a global approach aimed to identify GCMa target genes. We found 66 genes up-regulated and 11 genes down-regulated in GCMa-deficient chorionic tissue of mice at embryonic day 9.5. Moreover, we verified by quantitative reverse transcription-PCR all 11 down-regulated genes. The two most strongly down-regulated genes, integrin-alpha4 and retinoblastoma (Rb1), were further analyzed by promoter studies. Additionally, we identified down-regulation of the murine syncytin A gene, which is fundamental for syncytiotrophoblast formation. Finally, we proved strong down-regulation of integrin-alpha4 and Rb1 transcript levels by in situ hybridization in murine GCMa-deficient placentae at embryonic day 9.5. Our data demonstrate for the first time that genes encoding key regulators of placental tissue formation and architecture are regulated by GCMa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».