Vimentin is a dominant target of in situ humoral immunity in human lupus tubulointerstitial nephritis
Notice bibliographique
Résumé
In lupus nephritis (LuN), severe tubulointerstitial inflammation (TII) predicts progression to renal failure. Severe TII is associated with tertiary lymphoid neogenesis and in situ antigen-driven clonal B-cell selection. The dominant autoantigen(s) driving in situ B-cell selection in TII are not known. Single CD38 or Ki-67 B cells were laser captured from seven LuN biopsies. Twenty clonally expanded immunoglobulin heavy and light chain variable region pairs were cloned and expressed as antibodies. Seven more antibodies were cloned from flow-sorted CD38 cells from an eighth biopsy. Antigen characterization was performed using a combination of confocal microscopy, ELISA, screening protoarrays, immunoprecipitation and mass spectrometry. Serum IgG titers to the dominant antigen were determined in 45 LuN and 38 non-nephritic lupus samples using purified antigen-coated arrays. Autoantigen expression was localized by immunohistochemistry and immunofluorescence on normal and LuN kidney. Thirteen of 27 antibodies reacted with cytoplasmic structures, four reacted with nuclei and none with dsDNA, Sm or RNP. Vimentin was the only autoantigen identified by both mass spectrometry and on protoarray. Eleven anticytoplasmic TII antibodies directly bound vimentin. Vimentin was highly expressed by tubulointerstitial inflammatory cells, and tested TII antibodies preferentially bound inflamed tubulointerstitium. Finally, high titers of serum anti-vimentin antibodies were associated with severe TII ( P = 0.0001). Vimentin, an antigenic feature of inflammation, is a dominant autoantigen targeted in situ in LuN TII. This adaptive autoimmune response probably feeds forward to worsen TII and renal damage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».