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Enregistrement W1985397558 · doi:10.1186/ar4634

Vimentin is a dominant target of in situ humoral immunity in human lupus tubulointerstitial nephritis

2014· article· en· W1985397558 sur OpenAlexfundno aff
Marcus R. Clark, Anthony Chang, Kichul Ko, Carole J. Henry Dunand, Scott Henderson, D. Brandt, Natalya Kaverina, Vladimir M. Liarski, Patrick C. Wilson, Andrew J Kinloch

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthLupus Research AllianceCanadian Arthritis NetworkNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesArthritis SocietyCentral New York Community FoundationMerck KGaALupus Foundation of America
Mots-clésVimentinAntibodyLupus nephritisAntigenImmunologyBiologyPathologyMolecular biologyMedicineImmunohistochemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In lupus nephritis (LuN), severe tubulointerstitial inflammation (TII) predicts progression to renal failure. Severe TII is associated with tertiary lymphoid neogenesis and in situ antigen-driven clonal B-cell selection. The dominant autoantigen(s) driving in situ B-cell selection in TII are not known. Single CD38 or Ki-67 B cells were laser captured from seven LuN biopsies. Twenty clonally expanded immunoglobulin heavy and light chain variable region pairs were cloned and expressed as antibodies. Seven more antibodies were cloned from flow-sorted CD38 cells from an eighth biopsy. Antigen characterization was performed using a combination of confocal microscopy, ELISA, screening protoarrays, immunoprecipitation and mass spectrometry. Serum IgG titers to the dominant antigen were determined in 45 LuN and 38 non-nephritic lupus samples using purified antigen-coated arrays. Autoantigen expression was localized by immunohistochemistry and immunofluorescence on normal and LuN kidney. Thirteen of 27 antibodies reacted with cytoplasmic structures, four reacted with nuclei and none with dsDNA, Sm or RNP. Vimentin was the only autoantigen identified by both mass spectrometry and on protoarray. Eleven anticytoplasmic TII antibodies directly bound vimentin. Vimentin was highly expressed by tubulointerstitial inflammatory cells, and tested TII antibodies preferentially bound inflamed tubulointerstitium. Finally, high titers of serum anti-vimentin antibodies were associated with severe TII ( P = 0.0001). Vimentin, an antigenic feature of inflammation, is a dominant autoantigen targeted in situ in LuN TII. This adaptive autoimmune response probably feeds forward to worsen TII and renal damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,223
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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