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Enregistrement W1985420286 · doi:10.1074/jbc.m100518200

Subcellular Distribution and Membrane Topology of the Mammalian Concentrative Na+-Nucleoside Cotransporter rCNT1

2001· article· en· W1985420286 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMembrane-based Ion Separation Techniques
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleosideMembrane topologyTopology (electrical circuits)Distribution (mathematics)MembraneCell biologyCotransporterChemistryBiologyBiochemistryMembrane proteinMathematicsCombinatorics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rat transporter rCNT1 is the archetype of a family of concentrative nucleoside transporters (CNTs) found both in eukaryotes and in prokaryotes. In the present study we have used antibodies to investigate the subcellular distribution and membrane topology of this protein. rCNT1 was found to be expressed predominantly in the brush-border membranes of the polarized epithelial cells of rat jejunum and renal cortical tubules and in the bile canalicular membranes of liver parenchymal cells, consistent with roles in the absorption of dietary nucleosides, of nucleosides in the glomerular filtrate, or of nucleosides arising from the action of extracellular nucleotidases, respectively. The effect of endoglycosidase F treatment on wild-type and mutant rCNT1 expressed in Xenopus oocytes revealed that the recombinant transporter could be glycosylated at either or both of Asn605 and Asn643, indicating that its C terminus is extracellular. In contrast, potential N-glycosylation sites introduced near the N terminus, or between putative transmembrane (TM) helices 4 and 5, were not glycosylated. The deduced orientation of the N terminus in the cytoplasm was confirmed by immunocytochemistry on intact and saponin-permeabilized Chinese hamster ovary cells expressing recombinant rCNT1. These results, in conjunction with extensive analyses of CNT family protein sequences using predictive algorithms, lead us to propose a revised topological model, in which rCNT1 possesses 13 TM helices with the hydrophilic N-terminal and C-terminal domains on the cytoplasmic and extracellular sides of the membrane, respectively. Furthermore, we show that the first three TM helices, which are absent from prokaryote CNTs, are not essential for transporter function; truncated proteins lacking these helices, derived either from rCNT1 or from its human homolog hCNT1, were found to retain significant sodium-dependent uridine transport activity when expressed in oocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,320

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle