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Enregistrement W1985449549 · doi:10.1074/jbc.m209160200

Structure of an F-actin Trimer Disrupted by Gelsolin and Implications for the Mechanism of Severing

2003· article· en· W1985449549 sur OpenAlexfundno aff
John Dawson, Elena P. Sablin, James A. Spudich, Robert J. Fletterick

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésGelsolinTrimerMechanism (biology)ActinChemistryCell biologyBiophysicsBiochemistryBiologyDimerPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stable oligomers of filamentous actin were obtained by cross-linking F-actin with 1,4-N,N'-phenylenedimaleimide and depolymerization with excess segment-1 of gelsolin. Segment-1-bound and cross-linked actin oligomers containing either two or three actin subunits were purified and shown to nucleate actin assembly. Kinetic assembly data from mixtures of monomeric actin and the actin oligomers fit a nucleation model where cross-linked actin dimer or trimer reacts with an actin monomer to produce a competent nucleus for filament assembly. We report the three-dimensional structure of the segment-1-actin hexamer containing three actin subunits, each with a tightly bound ATP. Comparative analysis of this structure with twelve other actin structures provides an atomic level explanation for the preferential binding of ATP by the segment-1-complexed actin. Although the structure of segment-1-bound actin trimer is topologically similar to the helical model of F-actin (1), it has a distorted symmetry compared with that of the helical model. This distortion results from intercalation of segment-1 between actin protomers that increase the rise per subunit and rotate each of the actin subunits relative to their positions in F-actin. We also show that segment-1 of gelsolin is able to sever actin filaments, although the severing activity of segment-1 is significantly lower than full-length gelsolin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,191

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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