Metagenomic analysis of the pinewood nematode microbiome reveals a symbiotic relationship critical for xenobiotics degradation
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Notice bibliographique
Résumé
Our recent research revealed that pinewood nematode (PWN) possesses few genes encoding enzymes for degrading α-pinene, which is the main compound in pine resin. In this study, we examined the role of PWN microbiome in xenobiotics detoxification by metagenomic and bacteria culture analyses. Functional annotation of metagenomes illustrated that benzoate degradation and its related metabolisms may provide the main metabolic pathways for xenobiotics detoxification in the microbiome, which is obviously different from that in PWN that uses cytochrome P450 metabolism as the main pathway for detoxification. The metabolic pathway of degrading α-pinene is complete in microbiome, but incomplete in PWN genome. Experimental analysis demonstrated that most of tested cultivable bacteria can not only survive the stress of 0.4% α-pinene, but also utilize α-pinene as carbon source for their growth. Our results indicate that PWN and its microbiome have established a potentially mutualistic symbiotic relationship with complementary pathways in detoxification metabolism.
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Prédiction distillée sur la base complète
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle