Recombination within sympatric cryptic species of the insect pathogenic fungus <i>Metarhizium anisopliae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Metarhizium anisopliae is an insect pathogenic fungus with a worldwide distribution. It is being developed and used as a biocontrol agent against a wide range of insect pests but relatively little is known of the life history of this fungus. We tested hypotheses concerning reproductive isolation and recombination in a sample of heat-active (ability to grow at 37 degrees C) and cold-active (ability to grow at 8 degrees C) sympatrically occurring isolates of M. anisopliae from Ontario, Canada by assaying nucleotide sequence variation at six polymorphic loci: the internally transcribed spacer (ITS) region of the nuclear ribosomal DNA repeat, and portions of calmodulin (CAL), chitin synthase (CHS), subtilisin-like protease (PR1), neutral trehalase (NTL) and actin (ACT)-encoding genes. The most parsimonious trees constructed showed a topology consistent with the heat-active and cold-active isolates as two monophyletic groups. We then applied Genealogical Concordance Phylogenetic Species Recognition (GCPSR) to the genealogical trees and concluded that the transition from concordance among branches to incongruity among branches delimited two species of M. anisopliae within Ontario. The GCPSR of two species was supported by intraspecific incongruity within each species when tested using the Partition Homogeneity test, indicating recombination. The GCPSR of two species also corresponded to the heat-active and cold-active groups. As the groups are morphologically indistinguishable we applied the term 'cryptic species'. Therefore, the sympatrically occurring heat-active and cold-active isolates represent different cryptic species with a history of recombination among isolates within each species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».