Genomics, Transcriptomics and Methylomics: Alternative Approaches for the Analysis of Serotonin System and Antipsychotic Response
Notice bibliographique
Résumé
Serotonin receptors blockade is the major basis for the action of atypical antipsychotic drugs. Genetic factors affecting the density and/or function of serotonergic receptors, transporters and enzymes may therefore affect antipsychotic response. This exploratory study investigates the effect of ten polymorphisms from HTR1A, HTR1D, HTR2A, HTR3A, HTR3B, HTR4, HTR6, SLC6A4, TPH1, TPH2 genes on antipsychotic response in a sample of 289 patients with DSM-diagnosis of schizophrenia. Clinical Response was assessed using Brief Psychiatric Rating Scale (BPRS). Response was determined as 20% reduction improvement of BPRS compared to baseline. Selection of the biological relevant interactions, regardless the phenotype was performed using different statistics strategies regardless the phenotype to investigate epistasis within the serotonin system. the test for relevant interaction selection showed that 5HT4 and 5HT6 can be in epistatic relationship. the single locus analysis of these two receptor polymorphisms showed no significant results and the logistic regression model incorporating both genes, the clinical and demographic variables was not significant. Even this result is not significant, this strategy aimed to investigate the epistatic effect among genes could be useful for finding relevant biological interaction among genetic variants. Furthermore we are currently analyzing the methylation level of HTR2A in responders and non-responders, this epigenetic analysis will be very valuable in adding more information to the classic pharmacogenetic studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».