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Enregistrement W1985583503 · doi:10.1139/w09-074

Phenotypic, genotypic, and symbiotic diversities in strains nodulating clover in different soils in Spain

2009· article· en· W1985583503 sur OpenAlexvenueno aff
Martha-Helena Ramírez-Bahena, Encarna Velázquez, Félix Fernández-Santos, Álvaro Péix, Eustoquio Martı́nez-Molina, Pedro F. Mateos

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRhizobium leguminosarumRhizobiaPisumPhaseolusSymbiosisBotany16S ribosomal RNAGenotypeRhizobiaceaeHost (biology)SativumStrain (injury)GeneGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trifolium species are the most common legumes present in wild Spanish soils; however, there are no studies to date on the diversity of rhizobia nodulating clover in Spain. Twenty strains from different Spanish soils with acidic, neutral, and basic pH were selected to study their genotypic, phenotypic, and symbiotic features. The results showed that the isolates were genotypically diverse, displaying 12 different DNA fingerprint patterns and also 14 different plasmid profiles. Although they have 16S rRNA gene sequences that are nearly identical to that of the type strain of Rhizobium leguminosarum, their recA and atpD gene sequences were phylogenetically divergent from those of R. leguminosarum reference strains, and phenotypic divergence as well as different host ranges were also found. Although most of them nodulated both Trifolium and Phaseolus, only 5 strains were also able to nodulate Pisum. The results of the effectiveness analysis showed a high variability in the symbiotic characteristics of our strains and suggested that Pisum is the more restrictive host of this group. Interestingly, some of the Trifolium isolates showed an ability to promote growth of Pisum in the absence of nodulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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