DNA hybridization assay for detection of nucleopolyhedrovirus in whitemarked tussock moth (Orgyia leucostigma) larvae
Notice bibliographique
Résumé
DNA dot-blot hybridization assays utilizing a horseradish peroxidase-labelled whole genomic DNA probe and enhanced chemiluminescence were conducted to quantify detection thresholds of nucleopolyhedrovirus (NPV) in whitemarked tussock moth (Orgyia leucostigma) larvae. The minimum detection thresholds for an aqueous suspension of occlusion bodies (OBs), OBs added to macerates of non-infected larvae and OBs in macerates of diseased larvae were 7.8 x 10(3), 7.8 x 10(3), and 1.5 x 10(3) OBs, respectively. Purified viral DNA was detected at a concentration of 1.6 x 10(-1) ng in a 20 microliters volume. The presence of pre-occluded viral nucleocapsids and DNA, inherent to infected larvae, improved the detection threshold five-fold compared with OBs alone. Larval tissues did not block the detection system utilized, nor did they bind non-specifically to the probe. Detection thresholds, upon sequential hybridization of the same membrane, on average deteriorated two-fold between the first and second hybridization and an additional six-fold between the second and third hybridization. NPV infection was detected two days post-inoculation (pi) in about one-third of the larvae examined and in almost all larvae three days pi. Microscopic analysis of stained larval smears missed NPV infection in almost all larvae two days pi and about two-thirds of the larvae three days pi. Results from the two methods of analysis were not comparable until four days pi. The detection system utilized is a reliable, efficient and simple method for the early detection of NPV infection in large numbers of larvae and may be used for further studies quantifying the role of this baculovirus in the ecology of whitemarked tussock moth populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».