MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1985701259 · doi:10.1021/bi0480584

DNA Damage Induced Hyperphosphorylation of Replication Protein A. 1. Identification of Novel Sites of Phosphorylation in Response to DNA Damage

2005· article· en· W1985701259 sur OpenAlexfundno aff
Jonathan E. Nuss, Steve M. Patrick, Greg G. Oakley, Gerald M. Alter, Jacob G. Robison, Kathleen Dixon, John J. Turchi

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer InstituteUniversity of Calgary
Mots-clésReplication protein APhosphorylationDNA damageProtein subunitHyperphosphorylationDNA replicationReplication factor CMolecular biologyAphidicolinEukaryotic DNA replicationBiologyProtein phosphorylationDNAGel electrophoresisBiochemistryChemistryCell biologyDNA-binding proteinProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Replication protein A (RPA) is the predominant eukaryotic single-stranded DNA binding protein composed of 70, 34, and 14 kDa subunits. RPA plays central roles in the processes of DNA replication, repair, and recombination, and the p34 subunit of RPA is phosphorylated in a cell-cycle-dependent fashion and is hyperphosphorylated in response to DNA damage. We have developed an in vitro procedure for the preparation of hyperphosphorylated RPA and characterized a series of novel sites of phosphorylation using a combination of in gel tryptic digestion, SDS-PAGE and HPLC, MALDI-TOF MS analysis, 2D gel electrophoresis, and phosphospecific antibodies. We have mapped five phosphorylation sites on the RPA p34 subunit and five sites of phosphorylation on the RPA p70 subunit. No modification of the 14 kDa subunit was observed. Using the procedures developed with in vitro phosphorylated RPA, we confirmed a series of phosphorylation events on RPA from HeLa cells that was hyperphosphorylated in vivo in response to the DNA damaging agents, aphidicolin and hydroxyurea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistryMême sujetDNA Repair MechanismsTravaux en français237 207