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Enregistrement W1985811656 · doi:10.1021/bi700956c

Kinetic Characterization and Identification of the Acylation and Glycosylation Sites of Recombinant Human γ-Glutamyltranspeptidase

2007· article· en· W1985811656 sur OpenAlexaff
Roselyne Castonguay, Dany Halim, Mylène Morin, Alexandra Fürtös, Christian Lherbet, Éric Bonneil, Pierre Thibault, Jeffrey W. Keillor

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosylationAcylationRecombinant DNAChemistryIdentification (biology)BiochemistryStereochemistryBiologyCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gamma-glutamyltranspeptidase (GGT) is a heterodimeric enzyme important for glutathione homeostasis control. It has also been implicated in many physiological disorders, including Parkinson's disease, apoptosis inhibition, and diabetes. In the first step of its ping-pong mechanism it binds glutathione, its in vivo substrate, and releases cysteinylglycine upon formation of an acyl-enzyme intermediate. This intermediate can then react with water to release glutamate as a hydrolysis product or with an amino acid or dipeptide to form a transpeptidation product. Further detailed study of the mechanism underlying these reactions is hindered at least for some GGTs by the low quantities of protein available after a multistep purification from tissue. In the present work the gene for human GGT was cloned into the pPICZalphaA vector and transformed into Pichia pastoris to express as a 68 kDa His-tagged protein. The optimized expression and secretion of this enzyme in 1 L of culture and subsequent purification by immobilized metal affinity chromatography yielded 1.6 mg of purified enzyme having a specific activity of 237 U/mg. Kinetic parameters for the transpeptidation reaction between glutathione and glycylglycine were determined by mass spectrometry, giving a kcat of 13.4 x 10(3) min-1 and apparent KM values of 1.11 mM for glutathione and 8.1 mM for glycylglycine. The GGT-mediated hydrolysis of glutathione was also studied, providing a kcat of 53 min-1 and a KM value of 7.3 microM for glutathione. Incubation of the enzyme with a mechanism-based inhibitor, enzymatic digest, and mass spectrometric analysis provided the first unambiguous identification of Thr381 as the active site nucleophile of human gamma-glutamyltranspeptidase, and confirmed four of the seven N-linked glycosylation sites. These structural and kinetic data are discussed with respect to a homology model generated to facilitate visualization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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