MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1985828077 · doi:10.1021/bi4005683

Solution Structure and Dynamics of Human Hemoglobin in the Carbonmonoxy Form

2013· article· en· W1985828077 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésChemistryDimerCrystallographyProtein structureNanosecondSofteningMolecular dynamicsStereochemistryComputational chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The solution structure of human adult carbonmonoxy hemoglobin (HbCO A) was refined using stereospecifically assigned methyl groups and residual dipolar couplings based on our previous nuclear magnetic resonance structure. The tertiary structures of individual chains were found to be very similar to the X-ray structures, while the quaternary structures in solution at low salt concentrations resembled the X-ray R structure more than the R2 structure. On the basis of chemical shift perturbation by inositol hexaphosphate (IHP) titration and docking, we identified five possible IHP binding sites in HbCO A. Amide-water proton exchange experiments demonstrated that αThr38 located in the α1β2 interface and several loop regions in both α- and β-chains were dynamic on the subsecond time scale. Side chain methyl dynamics revealed that methyl groups in the α1β2 interface were dynamic, but those in the α1β1 interface were quite rigid on the nanosecond to picosecond and millisecond to microsecond time scales. All the data strongly suggest a dynamic α1β2 interface that allows conformational changes among different forms (like T, R, and R2) easily in solution. Binding of IHP to HbCO A induced small structural and dynamic changes in the α1β2 interface and the regions around the hemes but did not increase the conformational entropy of HbCO A. The binding also caused conformational changes on the millisecond time scale, very likely arising from the relative motion of the α1β1 dimer with respect to the α2β2 dimer. Heterotropic effectors like IHP may change the oxygen affinity of Hb through modulating the relative motion of the two dimers and then further altering the structure of heme binding regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,358

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle