MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1985871989 · doi:10.1128/jcm.01188-06

Identification of “ <i>Haematobacter</i> ,” a New Genus of Aerobic Gram-Negative Rods Isolated from Clinical Specimens, and Reclassification of <i>Rhodobacter massiliensis</i> as “ <i>Haematobacter massiliensis</i> comb. nov.”

2007· article· en· W1985871989 sur OpenAlexaff
Leta O. Helsel, D G Hollis, Arnold G. Steigerwalt, Roger E. Morey, Jean G. Jordan, Tin Tin Aye, Jon Radosevic, Deanna Jannat‐Khah, Dorothy Thiry, David Lonsway, Jean B. Patel, Maryam Daneshvar, Paul N. Levett

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensSaskatchewan Disease Control Laboratory
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiologyBiologyClinical microbiologyIdentification (biology)GenusEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Twelve strains of gram-negative, nonfermenting rods recovered mainly from septicemic patients were studied using conventional and molecular methods. The phenotypic profiles of these strains most closely resembled Psychrobacter phenylpyruvicus. They produced catalase, oxidase, urease, and H(2)S (lead acetate paper) but did not produce indole, reduce nitrate or nitrite, or hydrolyze gelatin or esculin. No acid production was observed in a King's oxidation-fermentation base containing d-glucose, d-xylose, d-mannitol, sucrose, lactose, or maltose. All strains were nonmotile and nonpigmented. Most strains produced green discoloration on blood agar. All strains grew at 25 degrees C and 35 degrees C and most grew on MacConkey agar. They shared a common cellular fatty acid (CFA) profile characterized by large amounts (56% to 90%) of 18:1omega7c and the presence of 3-OH-10:0, 16:1omega7c, 16:0, and 19:0cycomega8c that overall was most similar to that of Rhodobacter species but was quite distinct from that of P. phenylpyruvicus. The MICs for most beta-lactams, fluoroquinolones, aminoglycosides, and carbapenems were low. MICs for aztreonam and piperacillin were higher, with MICs for some strains of > 64 mg/liter and > 128 mg/liter, respectively. Polyphasic analysis of these strains, including morphological, biochemical, CFA composition, DNA-DNA hybridization, 16S rRNA gene sequencing, and percent guanine-plus-cytosine (G+C) content analysis, demonstrated that these strains and Rhodobacter massiliensis represent a new genus, "Haematobacter" (proposed name), with the species H. missouriensis (type strain H1892(T) = CCUG 52307(T) = CIP 109176(T)) and H. massiliensis comb. nov. (type strain Framboise(T) = CCUG 47968(T) = CIP 107725(T)) and an unnamed genomospecies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,233
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical MicrobiologyMême sujetVibrio bacteria research studiesTravaux en français237 207