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Enregistrement W1985878847 · doi:10.1186/1756-0500-1-68

The transcriptional cofactor MIER1-beta negatively regulates histone acetyltransferase activity of the CREB-binding protein

2008· article· en· W1985878847 sur OpenAlexafffund
Tina Blackmore, Corinne F Mercer, Gary D. Paterno, Laura L. Gillespie

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHistone acetyltransferaseCREB-binding proteinHistone deacetylase 2Molecular biologyHistone deacetylaseTranscription factorSAP30AcetyltransferaseHistoneBiologyCREBChemistryBiochemistryAcetylationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Mier1 encodes a novel transcriptional regulator and was originally isolated as a fibroblast growth factor early response gene. Two major protein isoforms have been identified, MIER1alpha and beta, which differ in their C-terminal sequence. Previously, we demonstrated that both isoforms recruit histone deacetylase 1 (HDAC1) to repress transcription. To further explore the role of MIER1 in chromatin remodeling, we investigated the functional interaction of MIER1 with the histone acetyltransferase (HAT), Creb-binding protein (CBP). FINDINGS: Using GST pull-down assays, we demonstrate that MIER1 interacts with CBP and that this interaction involves the N-terminal half (amino acids 1-283) of MIER1, which includes the acidic activation and ELM2 domains and the C-terminal half (amino acids 1094-2441) of CBP, which includes the bromo-, HAT, C/H3 and glutamine-rich domains. Functional analysis, using HEK293 cells, shows that the CBP bound to MIER1 in vivo has no detectable HAT activity. Histone 4 peptide binding assays demonstrate that this inhibition of HAT activity is not the result of interference with histone binding. CONCLUSION: Our data indicate that an additional mechanism by which MIER1 could repress transcription involves the inhibition of histone acetyltransferase activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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