Short-term variability in bacterial abundance, cell properties, and incorporation of leucine and thymidine in subarctic sea ice
Notice bibliographique
Résumé
Sea ice is a biome of immense size and provides a range of habitats for diverse microbial communities, many of which are adapted to living at low temperatures and high salinities in brines.We measured simultaneous incorporation of thymidine (TdR) and leucine (Leu), bacterial cell abundance and cell population properties (by flow cytometry) in subarctic sea ice in SW Greenland.Short-term temporal variability was moderate, and steep environmental gradients, typical for sea ice, were the main drivers of the variability in bacterial cell properties and activity.Low nucleic acid (LNA) bacteria, previously linked to oligotrophic ecotypes in marine habitats, were more abundant in the upper ice layers, whereas high nucleic acid (HNA) bacteria dominated in lower ice, where organic carbon was in high concentrations.Leu incorporation was saturated at micromolar concentrations, as known from freshwater and marine biofilm systems.Leu:TdR ratios were high (up to > 300) in lowermost ice layers, and when compared to published respiration measurements, these results suggest non-specific Leu incorporation.There was evidence of polyhydroxyalkanoate (PHA)-containing bacteria in the sea ice, shown by brightly fluorescing intracellular inclusions after Nile Blue A staining.High Leu saturating concentrations coupled with the occurrence of PHA-producing organisms further highlight the similarity of sea ice internal habitats to biofilm-like systems rather than to open-water systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».