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Enregistrement W1985927272 · doi:10.1111/j.1471-4159.2009.06045.x

The atypical protein kinase C in <i>Aplysia</i> can form a protein kinase M by cleavage

2009· article· en· W1985927272 sur OpenAlexafffund
Joanna K. Bougie, Travis Lim, Carole A. Farah, Varsha Manjunath, Ikue Nagakura, Gino B. Ferraro, Wayne S. Sossin

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAplysiaCleavage (geology)Protein kinase CProtein kinase AMitogen-activated protein kinase kinaseMAP2K7Cyclin-dependent kinase 2Cyclin-dependent kinase 9ChemistryMAP kinase kinase kinaseBiochemistryCell biologyKinaseBiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In vertebrates, a brain-specific transcript from the atypical protein kinase C (PKC) zeta gene encodes protein kinase M (PKM) zeta, a constitutively active kinase implicated in the maintenance of synaptic plasticity and memory. We have cloned the atypical PKC from Aplysia, PKC Apl III. We did not find a transcript in Aplysia encoding PKMzeta, and evolutionary analysis of atypical PKCs suggests formation of this transcript is restricted to vertebrates. Instead, over-expression of PKC Apl III in Aplysia sensory neurons leads to production of a PKM fragment of PKC Apl III. This cleavage was induced by calcium and blocked by calpain inhibitors. Moreover, nervous system enriched spliced forms of PKC Apl III show enhanced cleavage. PKC Apl III could also be activated through phosphorylation downstream of phosphoinositide 3-kinase. We suggest that PKM forms of atypical PKCs play a conserved role in memory formation, but the mechanism of formation of these kinases has changed over evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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