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Enregistrement W1985933977 · doi:10.1080/03008200390152179

Identification of FGF2-Response Element in the Rat Bone Sialoprotein Gene Promoter

2003· article· en· W1985933977 sur OpenAlexaff
Emi Shimizu-Sasaki, Muneyoshi Yamazaki, Shunsuke Furuyama, Hiroshi Sugiya, Jaro Sodek, Yorimasa Ogata

Notice bibliographique

RevueConnective Tissue Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquedental development and anomalies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBone sialoproteinOsteoblastParacrine signallingCell biologyAutocrine signallingMolecular biologyFibroblast growth factorTranscription factorBiologyTransfectionMesenchymal stem cellChemistryPromoterGene expressionCell cultureGeneOsteocalcinIn vitroGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bone sialoprotein (BSP), an early marker of osteoblast differentiation, has been implicated in the nucleation of hydroxyapatite during de novo bone formation. Basic fibroblast growth factor (FGF2) is recognized as a potent mitogen for a variety of mesenchymal cells. In skeletal tissues, FGF2 produced by osteoblasts accumulates in the bone matrix and acts as an autocrine/paracrine regulator of bone cells. To determine the molecular mechanism of FGF2 regulation of osteogenesis, we have analyzed the effects of FGF2 on the expression of BSP in the rat osteosarcoma cell line ROS 17/2.8. FGF2 at 10 ng/ml, increased BSP mRNA levels approximately 4-fold; the stimulation was first evident at 3 hr, reached maximal levels at 6 hr. The stability of the BSP mRNA was not significantly affected by FGF2, suggesting that the increased mRNA was due to increased transcription. From transient transfection analyses using various BSP promoter-luciferase constructs, a FGF2 response element (FRE) (nts -92 to -85, "GGTGAGAA") was identified as a target of transcriptional activation by FGF2. Ligation of two copies of the FRE 5' to an SV40 promoter was sufficient to confer FGF responsive transcription. A sequence-specific protein-DNA complex, formed with a double-stranded oligonucleotide encompassing the FRE and nuclear extracts from ROS 17/2.8 cells, but not from fibroblasts, was increased following FGF2 stimulation. Several point mutations within the critical FRE sequence abrogated the formation of this complex and suppressed both basal and FGF2-mediated promoter activity. Thus, we have identified a novel FRE within the proximal promoter of the BSP gene that mediates both constitutive and FGF2-induced BSP transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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