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Enregistrement W1985964388 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-14-0307

Ectopic Expression of Cancer–Testis Antigens in Cutaneous T-cell Lymphoma Patients

2014· article· en· W1985964388 sur OpenAlexaff
Ivan V. Litvinov, Brendan Cordeiro, Yuanshen Huang, Hanieh Zargham, Kevin Pehr, Marc-André Doré, Martin Gilbert, Youwen Zhou, Thomas S. Kupper, Denis Sasseville

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous lymphoproliferative disorders research
Établissements canadiensUniversité LavalSKiN HealthUniversity of British ColumbiaQuest University CanadaMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésAntigenVorinostatEctopic expressionCancer researchRomidepsinLymphomaCutaneous T-cell lymphomaBiologyCancerDownregulation and upregulationImmunologyMedicineMycosis fungoidesCell cultureHistone deacetylaseGeneHistoneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The pathogenesis of cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) remains only partially understood. A number of recent studies attempted to identify novel diagnostic markers and future therapeutic targets. One group of antigens, cancer-testis (CT) antigens, normally present solely in testicular germ cells, can be ectopically expressed in a variety of cancers. Currently, only a few studies attempted to investigate the expression of CT antigens in CTCL. EXPERIMENTAL DESIGN: In the present work, we test the expression of CT genes in a cohort of patients with CTCL, normal skin samples, skin from benign inflammatory dermatoses, and in patient-derived CTCL cells. We correlate such expression with the p53 status and explore molecular mechanisms behind their ectopic expression in these cells. RESULTS: Our findings demonstrate that SYCP1, SYCP3, REC8, SPO11, and GTSF1 genes are heterogeneously expressed in patients with CTCL and patient-derived cell lines, whereas cTAGE1 (cutaneous T-cell lymphoma-associated antigen 1) was found to be robustly expressed in both. Mutated p53 status did not appear to be a requirement for the ectopic expression of CT antigens. While T-cell stimulation resulted in a significant upregulation of STAT3 and JUNB expression, it did not significantly alter the expression of CT antigens. Treatment of CTCL cells in vitro with vorinostat or romidepsin histone deacetylase inhibitors resulted in a significant dose-dependent upregulation of mRNA but not protein. Further expression analysis demonstrated that SYCP1, cTAGE1, and GTSF1 were expressed in CTCL, but not in normal skin or benign inflammatory dermatoses. CONCLUSIONS: A number of CT genes are ectopically expressed in patients with CTCL and can be used as biomarkers or novel targets for immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,494
Écart entre enseignants0,383 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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