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Enregistrement W1986152163 · doi:10.1186/2046-2530-1-s1-o22

Investigating the link between PCP signalling and ciliogenesis during zebrafish development

2012· article· en· W1986152163 sur OpenAlexaff
Antonia Borovina, Brian Ciruna

Notice bibliographique

RevueCilia · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCiliogenesisCiliumBiologyZebrafishCell biologyBasal bodyIntraflagellar transportWnt signaling pathwayEffectorMotile ciliumContext (archaeology)GastrulationPolycystic kidney diseaseConvergent extensionCiliopathyMutantGeneticsSignal transductionPhenotypeFlagellumEmbryoGeneEmbryogenesisKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polycystic kidney disease (PKD) is characterized by dilated collecting tubules causing fluid filled cysts and enlarged kidneys. Dilated tubules can result from disrupted convergence and extension (C&E) movements and defects in oriented cell divisions (OCD). Planar cell polarity (PCP) signalling has been implicated in PKD since defects in C&E and OCD are both characteristic of disrupted PCP. Surprisingly, genetic studies of mutations causing PKD predominantly affect proteins that localize near cilia and basal bodies. The functional relationship between cilia and PCP signalling in the context of PKD is still poorly understood. Previous studies of PCP effector proteins suggested that PCP signalling was required for cilia formation. However, these proteins are not specific to PCP signalling and are shared with other Wnt pathways. To determine the role of a core and specific PCP regulator on ciliogenesis, we examined maternal-zygotic (MZ) vangl2 zebrafish mutants. Analysis of MZvangl2 mutants revealed that PCP is not required for cilia formation but is required for the posterior tilting and posterior positioning of motile cilia. To determine whether cilia were required to establish cell polarity, we generated MZift88 mutants where ciliogenesis is completely abolished. MZift88 mutants have normal C&E movements, suggesting that cilia are not directly required for PCP mediated morphogenetic movements. However, we have observed defects in PCP-controlled OCD occurring during gastrulation. Remarkably, these divisions occur prior to cilia formation, suggesting a cilia-independent role for IFT proteins in cell divisions. We are currently determining whether IFT88 regulates all OCD or just those that are PCP-controlled.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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