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Enregistrement W1986188431 · doi:10.1002/prot.20999

Dynamic control of allosteric antagonism of leukocyte function antigen‐1 and intercellular adhesion molecule‐1 interaction

2006· article· en· W1986188431 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueProteins Structure Function and Bioinformatics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcMaster University
Mots-clésAllosteric regulationBiophysicsChemistryAllosteric enzymeIntercellular Adhesion Molecule-1Small moleculeFunction (biology)Cell adhesion moleculeIntracellularCell biologyReceptorBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leukocyte function associated antigen-1 (LFA-1) plays a critical role in T cell migration and has been recognized as a therapeutic target for immune disorders. Several classes of small molecule antagonists have been developed to block LFA-1 interaction with intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1). Recent structural studies show that the antagonists bind to an allosteric site in the I-domain of LFA-1. However, it is not yet clear how these small molecules work as antagonists since no significant conformational change is observed in the I-domain-antagonist complex structures. Here we present a computational study suggesting how these allosteric antagonists affect the dynamics of the I-domain. The lowest frequency vibrational mode calculated from an LFA-1 I-domain structure shows large scale "coil-down" motion of the C-terminal alpha7 helix, which may lead to the open form of the I-domain. The presence of an allosteric antagonist greatly reduces this motion of the alpha7 helix as well as other parts of the I-domain. Thus, our study suggests that allosteric antagonists work by eliminating breathing motion that leads to the open conformation of the I-domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle