Proteomic identification of <i><scp>L</scp>isteria monocytogenes</i> surface‐associated proteins
Notice bibliographique
Résumé
This study aimed to identify proteins exposed on the surface of Listeria monocytogenes cells for diagnostic reagent development. Brief trypsin treatment of L. monocytogenes cells followed by peptide separation and identification by nano-LC and online-MS/MS was performed. In parallel, as a negative control, proteins secreted into the digest buffer as well as proteins from cell lysis were identified. One hundred and seventy-four proteins were identified in at least two of three trials in either the negative control or during cell digest. Nineteen surface, 21 extracellularly secreted, 132 cytoplasmic, and two phage proteins were identified. Immunofluorescence microscopy of L. monocytogenes cells revealed the surface localization of two potential candidates for L. monocytogenes isolation and detection: lipoprotein LMOf2365_0546 and PBPD1 (LMOf2365_2742). In this report, we present the first data set of surface-exposed L. monocytogenes proteins currently available. The data have been deposited to the ProteomeXchange Consortium with identifier PXD000035.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».