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Enregistrement W1986399871 · doi:10.1139/y03-126

Apoptose radio-induite: une nouvelle approche par microspectroscopie infrarouge

2004· article· en· W1986399871 sur OpenAlexvenueno aff
Nathalie Gault, Jean‐Luc Poncy, Jean-Louis Lefaix

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHaCaTApoptosisMolecular biologyFlow cytometryAnnexinChemistryIrradiationDNABiologyBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: to characterize radiation-induced apoptosis in human cells using Fourier transform infrared microspectroscopy (FT-IRM) as a new analytical tool. MATERIAL AND METHODS: Normal human circulating lymphocytes were given a gamma ray dose of 6 Gy, or treated with t-butyl hydroperoxide (t-BuOH). HaCaT keratinocytes were given a dose of 20 Gy. Cells were deposited on ZnS windows for infrared spectral acquisition 2 days and 2 h after irradiation and 2 h after t-BuOH treatment. Apoptosis was simultaneously assessed by flow cytometry analysis of cells displaying annexin-V-positive staining. RESULTS: The flow cytometry study showed that about 90% of sham and irradiated cells were annexin-V negative 2 h after irradiation. Two days after irradiation, 68% of lymphocytes and 76% of HaCaT cells were apoptotic, as well as 43% of lymphocytes treated with t-BuOH. In infrared spectra of these apoptotic cells, qualitative and quantitative changes were observed. In the 960-1245 and 1690-1720 cm-1 ranges, mainly attributed to nucleic acids, changes corresponding to conformational changes in DNA were associated with a decrease in the amount of detectable DNA. Conformational changes were also observed in secondary protein structure, in particular an increase in the amount of beta structures. These DNA and protein changes were associated with an increase in the detectable amount of lipids in apoptotic HaCaT cells only. Two hours after irradiation, depending on the dose and (or) the cell type, qualitative and quantitative changes were observed in the IR spectra in the amide I and amide II bands, mainly attributed to proteins. These changes were associated with a significant decrease in the 1700-1750 cm-1 range, mainly attributed to the -C=O ester groups of DNA and phospholipids, in the irradiated HaCaT cells only. CONCLUSION: Our results are in agreement with biochemical published data on radiation-induced apoptosis, and show that DNA is the first cellular target of radiation-induced apoptosis, which, however, also requires conformational changes and synthesis of cell proteins. They also demonstrate that FT-IRM may be useful for assessing the early radiation damage at the molecular level in human cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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