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Enregistrement W1986449731 · doi:10.4021/gr2009.04.1287

Bioinformatics Analysis and Validation of the Expressed Sequences Tag in Human Colorectal Adenocarcinoma

2009· article· en· W1986449731 sur OpenAlexvenueno aff
Yao Chen

Notice bibliographique

RevueGastroenterology Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal adenocarcinomaAdenocarcinomaSuppression subtractive hybridizationComplementary DNAMicroarrayColon adenocarcinomaMedicineMolecular biologyBioinformaticsComputational biologyGeneBiologyInternal medicinecDNA libraryGeneticsGene expressionCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: This study was to investigate some new pathological genes in colorectal adenocarcinoma of human. METHODS: Human colorectal adenocarcinoma tissues and normal colorectal tissues were taken and suppression subtractive hybridization (SSH) and cDNA microarray techniques were employed. From differentially expressed 86 expressed sequence tags (EST), 10 EST of the SSH were selected as seed sequence for bioinformatics analyses, semi-quantitative RT-PCR and PCR-sequencing. Each lane of semi-quantitative RT-PCR was analyzed by Q1 software. RESULTS: Among these 10 EST, it has been found that ES274070, ES274071, ES274076 and ES274081 may play role in the onset of colorectal adenocarcinoma in human. CONCLUSIONS: The ES274070, ES274071, ES274076 and ES274081 are related to the onset of human colorectal adenocarcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,246

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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