Synthesis, Characterisation, and In Vitro Evaluation of Pro<sup>2</sup>‐Ile<sup>3</sup>‐<i>S</i>‐Deoxo‐Amaninamide and Pro<sup>2</sup>‐<scp>D</scp>‐<i>allo</i>‐Ile<sup>3</sup>‐<i>S</i>‐Deoxo‐Amaninamide: Implications for Structure–Activity Relationships in Amanitin Conformation and Toxicity
Notice bibliographique
Résumé
The amatoxins are a family of toxic bicyclic peptides that inhibit RNA polymerase II. Herein we discuss an improved synthesis of these compounds from easily obtainable amino acids by means of a solid-phase methodology. Interestingly, we obtained two products of the same mass following our final macrocyclisation, relating to a similar distribution of products described in some previous reports. One of these products was the desired amatoxin; Pro(2)-Ile(3)-S-deoxo-amaninamide 1 b. The other compound, after thorough investigation, was confirmed to be the epimer Pro(2)-D-allo-Ile(3)-S-deoxo-amaninamide 1 a, not an atropisomer structure as previously suggested in syntheses of related amanitin analogues. Crystallographic data of 1 a confirms the presence of a betaII-turn, rather than a betaI-turn common to the natural toxin and 1 b. This difference explains the large variation in CD spectra, although it seems to have relatively little effect on the bioactivity in vitro. These data provide new insights into the bicyclic amatoxin structure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».