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Enregistrement W1986537627 · doi:10.1002/chem.200701297

Synthesis, Characterisation, and In Vitro Evaluation of Pro<sup>2</sup>‐Ile<sup>3</sup>‐<i>S</i>‐Deoxo‐Amaninamide and Pro<sup>2</sup>‐<scp>D</scp>‐<i>allo</i>‐Ile<sup>3</sup>‐<i>S</i>‐Deoxo‐Amaninamide: Implications for Structure–Activity Relationships in Amanitin Conformation and Toxicity

2008· article· en· W1986537627 sur OpenAlexaff
Jonathan P. May, Pierre‐Edouard Fournier, Brian O. Patrick, David M. Perrin

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSilymarin and Mushroom Poisoning
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpimerBicyclic moleculeStereochemistryBiologyAtropisomerChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The amatoxins are a family of toxic bicyclic peptides that inhibit RNA polymerase II. Herein we discuss an improved synthesis of these compounds from easily obtainable amino acids by means of a solid-phase methodology. Interestingly, we obtained two products of the same mass following our final macrocyclisation, relating to a similar distribution of products described in some previous reports. One of these products was the desired amatoxin; Pro(2)-Ile(3)-S-deoxo-amaninamide 1 b. The other compound, after thorough investigation, was confirmed to be the epimer Pro(2)-D-allo-Ile(3)-S-deoxo-amaninamide 1 a, not an atropisomer structure as previously suggested in syntheses of related amanitin analogues. Crystallographic data of 1 a confirms the presence of a betaII-turn, rather than a betaI-turn common to the natural toxin and 1 b. This difference explains the large variation in CD spectra, although it seems to have relatively little effect on the bioactivity in vitro. These data provide new insights into the bicyclic amatoxin structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,502
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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