Effects of <i>prd</i> Circadian Clock Mutations on FRQ-Less Rhythms in <i>Neurospora</i>
Notice bibliographique
Résumé
Rhythmic conidiation (spore formation) in Neurospora crassa provides a model system for investigating the molecular mechanisms of circadian rhythmicity. A feedback loop involving the frq, wc-1, and wc-2 gene products (FRQ/ WCC) is an important component of the mechanism; however, rhythmic conidiation can still be observed when these gene products are absent. The nature of the oscillator(s) that drives this FRQ-less rhythmicity (FLO) is an important question in Neurospora circadian biology. We have looked for interactions between FRQ/WCC and FLO by assaying the effects on FRQ-less rhythms of mutations known to affect the period in the presence of FRQ. We assayed 4 prd mutations (prd-1, prd-2, prd-3, and prd-4) under 2 conditions in frq(null) strains: long-period free-running rhythms in chol-1 strains grown without choline, and heat-entrainable rhythms in choline-sufficient conditions. We found effects of all 4 mutations on both types of FRQ-less rhythms. The greatest effects were seen with prd-1 and prd-2, which abolished free-running rhythms in the chol-1; frq(10) backgrounds and significantly affected entrained peak timing under heat-entrainment conditions in frq( 10) backgrounds. The prd-3 and prd-4 mutations had more subtle effects on period and stability of free-running rhythms in the chol-1; frq(10) backgrounds and had little effect on peak timing under heat-entrainment conditions in frq(10) backgrounds. These results, along with previously published evidence for effects of prd mutations on other FRQ-less rhythms, suggest that either there are common components shared between the FRQ/WCC oscillator and several FRQ-less oscillators or that there is a single oscillator driving all conidiation rhythms. We favor a model of the Neurospora circadian system in which a single FRQ-less oscillator drives conidiation and interacts with the FRQ/WCC feedback loop; the output or amplitude of the FRQ-less oscillator can be affected by many gene products and metabolic conditions that reveal FRQ-less rhythmicity. We propose that prd-1 and prd-2 are good candidates for components of the FRQ-less oscillator and that prd-3 and prd-4 act on the system mainly through effects on FRQ/WCC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».