Phylogeny and Evolution of Pharmacophagy in Tiger Moths (Lepidoptera: Erebidae: Arctiinae)
Notice bibliographique
Résumé
The focus of this study was to reconstruct a phylogenetic hypothesis for the moth subfamily Arctiinae (tiger moths, woolly bears) to investigate the evolution of larval and adult pharmacophagy of pyrrolizidine alkaloids (PAs) and the pathway to PA chemical specialization in Arctiinae. Pharmacophagy, collection of chemicals for non-nutritive purposes, is well documented in many species, including the model species Utetheisa ornatrix L. A total of 86 exemplar ingroup species representing tiger moth tribes and subtribes (68 genera) and nine outgroup species were selected. Ingroup species included the most species-rich generic groups to represent the diversity of host-plant associations and pharmacophagous behaviors found throughout Arctiinae. Up to nine genetic markers were sequenced: one mitochondrial (COI barcode region), one nuclear rRNA (D2 region, 28S rRNA), and seven nuclear protein-coding gene fragments: elongation factor 1-α protein, wingless, ribosomal protein subunit S5, carbamoylphosphate synthase domain regions, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, isocitrate dehydrogenase and cytosolic malate dehydrogenase. A total of 6984 bp was obtained for most species. These data were analyzed using model-based phylogenetic methods: maximum likelihood (ML) and Bayesian inference (BI). Ancestral pharmacophagous behaviors and obligate PA associations were reconstructed using the resulting Bayes topology and Reconstructing Ancestral States in Phylogenies (RASP) software. Our results corroborate earlier studies on the evolution of adult pharmacophagous behaviors, suggesting that this behavior arose multiple times and is concentrated in the phaegopterine-euchromiine-ctenuchine clade (PEC). Our results suggest that PA specialization may have arisen early in the phylogeny of the subfamily and that facultative larval pharmacophagous behaviors are the derived condition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».