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Enregistrement W1986849223 · doi:10.1158/1078-0432.tcmusa10-b44

Abstract B44: Probing the effects of linker flexibility in second mitochondria-derived activator of caspases mimetic dimers and assessing their ability to induce apoptosis in a MDA-MB-231 cell line

2010· article· en· W1986849223 sur OpenAlexaff
Taz Cheema, Robert N. Ben, Herman Cheung, Eric C. LaCasse

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXIAPCaspaseApoptosisInhibitor of apoptosisProgrammed cell deathActivator (genetics)ProteasesIntrinsic apoptosisAmino acidCancer cellCell biologyChemistryBiochemistryBiologyMolecular biologyEnzymeReceptorCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Programmed cell death (apoptosis) is the most common mechanism of cell death in eukaryotes. The ability of cancer cells to evade and inhibit apoptosis has become a hallmark feature of cancer. This is accomplished through a family of proteins known as the inhibitor of apoptosis proteins (lAPs). X-linked inhibitor of apoptosis protein (XIAP) is one of the best characterized lAPs. XIAP suppresses apoptosis by forming complexes with cysteine-aspartic proteases (caspase), in particular caspase −3, −7, and −9 through one of its baculovirus IAP repeat (BIR) domains. Second mitochondria-derived activator of caspases (SMAC) is an antagonist protein released from the mitochondria and into the cytosol, to disrupt the complexes produced between XIAP and caspase. SMAC binds to the BIR domains in XIAP through its tetra-peptide motif, AVPI. Studies have demonstrated that the first and third amino acid positions of this tetra-peptide motif are important for binding, while positions two and four can be modified to increase binding affinity (AXPX). It has also been shown that dimers of SMAC mimetics show greater potency than their monomer counter parts. Previously, our laboratory has synthesized and tested SMAC dimers using three glycine amino acids to link AXPX sequences. These compounds showed very little activity. We also synthesized and tested SMAC dimers comprised of a lysine amino acid, linking two AXPX sequences; these mimetics did display significant activity. In particular an (AKPF)2K sequence showed 50% cell death at 10 uM when combined with death ligand TRAIL. Synthesis of these compounds was conducted using solid phase peptide synthesis (SPPS) on a polystyrene resin. We hypothesized that flexibility in the linker joining the two AXPX sequences was necessary to increase binding affinity. Consequently several SMAC mimetic dimers built on two different linkers (gamma-amino butyric acid and ornithine), both of which have a four carbon spacer between each terminus, have been prepared and evaluated for activity using a MDA-MB-231 breast cancer cell line. The first series of SMAC mimetic compounds consists of MeAXPX-GABA-MeAXPX amino acid sequence while the second series of SMAC mimetics are comprised of a MeAXPX-Ornithine-XPXMeA amino acid sequence. All data and results, including synthesis, biological assays, and the testing of these compounds will be the major focus of this presentation. Citation Information: Clin Cancer Res 2010;16(14 Suppl):B44.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
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