A Proteomic Screen for Presynaptic Terminal N-type Calcium Channel (CaV2.2) Binding Partners
Notice bibliographique
Résumé
N type calcium channels (CaV2.2) play a key role in the gating of transmitter release at presynaptic nerve terminals. These channels are generally regarded as parts of a multimolecular complex that can modulate their open probability and ensure their location near the vesicle docking and fusion sites. However, the proteins that comprise this component remain poorly characterized. We have carried out the first open screen of presynaptic CaV2.2 complex members by an antibody-mediated capture of the channel from purified rat brain synaptosome lysate followed by mass spectroscopy. 589 unique peptides resulted in a high confidence match of 104 total proteins and 40 synaptosome proteome proteins. This screen identified several known CaV2.2 interacting proteins including syntaxin 1, VAMP, protein phosphatase 2A, G(O alpha), G beta and spectrin and also a number of novel proteins, including clathrin, adaptin, dynamin, dynein, NSF and actin. The unexpected proteins were classified within a number of functional classes that include exocytosis, endocytosis, cytoplasmic matrix, modulators, chaperones, and cell-signaling molecules and this list was contrasted to previous reports that catalogue the synaptosome proteome. The failure to detect any postsynaptic density proteins suggests that the channel itself does not exhibit stable trans-synaptic attachments. Our results suggest that the channel is anchored to a cytoplasmic matrix related to the previously described particle web.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».