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Enregistrement W1986876160 · doi:10.1021/ac8005236

Urinary Metabolic Profiles of Inflammatory Bowel Disease in Interleukin-10 Gene-Deficient Mice

2008· article· en· W1986876160 sur OpenAlexafffund
Travis B. Murdoch, Hao Fu, Sarah M. MacFarlane, Beate C. Sydora, Richard N. Fedorak, Carolyn M. Slupsky

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésMetaboliteMetabolomicsUrinary systemUrineInflammatory bowel diseaseChemistryInternal medicineEndocrinologyDiseaseBiochemistryBiologyMedicineChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic debilitating disorder that is thought to have both genetic and environmental contributors. Commensal microflora have been shown to play a key part in the disease process. Metabolomics, the study of large numbers of small molecule metabolites, has demonstrated that disease and/or changes in gut microbial composition modulate mammalian urine metabolite fingerprints. The aim of this project was to associate the development of IBD with specific changes in a mouse urinary metabolic fingerprint. Interleukin-10 (IL-10) gene-deficient mice were raised alongside age-matched 129/SvEv controls in conventional housing. Urine samples (22 h) were collected at ages 4, 6, 8, 12, 16, and 20 weeks. Metabolite concentrations were derived from analysis of nuclear magnetic resonance spectra, and both multivariate and two-way analysis of variance (ANOVA) statistical techniques were applied to the resulting data. Principal component analysis and partial least-squares-discriminant analysis of urine derived from the control and IL-10 gene-deficient mice revealed that while both groups initially had similar metabolic profiles, they diverged substantially with the onset of IBD as assessed through external phenotypic changes. Several metabolites, including trimethylamine (TMA) and fucose, changed dramatically in the IL-10 gene-deficient mice following 8 weeks of age, concomitant with the known timeline for development of severe histological injury. This study illustrates that metabolomics is effective at distinguishing IBD using urinary metabolite profiles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,795

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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