Analysis of genetic diversity in red clover (<i>Trifolium pratense</i>L.) breeding populations as revealed by RAPD genetic markers
Notice bibliographique
Résumé
Red clover is an important forage legume species for temperate regions and very little is known about the genetic organization of its breeding populations. We used random amplified polymorphic DNA (RAPD) genetic markers to address the genetic diversity and the distribution of variation in 20 breeding populations and cultivars from Chile, Argentina, Uruguay, and Switzerland. Genetic distances were calculated for all possible pairwise combinations. A high level of polymorphism was found and the proportion of polymorphic loci across populations was 74.2%. A population derived from a non-certified seedlot displayed a higher proportion of polymorphic loci than its respective certified seedlot. Gene diversity values and population genetics parameters suggest that the populations analyzed are diverse. An analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the largest proportion of variation (80.4%) resides at the within population level. RAPD markers are a useful tool for red clover breeding programs. A dendrogram based on genetic distances divided the breeding populations analyzed into three distinct groups. The amount and partition of diversity observed can be of value in identifying the populations that parents of synthetic cultivars are derived from and to exploit the variation available in the populations analyzed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».