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Enregistrement W1987233255 · doi:10.1371/journal.ppat.1000344

Studies of a Ring-Cleaving Dioxygenase Illuminate the Role of Cholesterol Metabolism in the Pathogenesis of Mycobacterium tuberculosis

2009· article· en· W1987233255 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of TorontoQueen's UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaJohns Hopkins UniversityU.S. Department of Energy
Mots-clésMycobacterium tuberculosisMutantBiochemistryEnzymeChemistryPathogenesisBinding siteDioxygenaseMicrobiologyCatecholTuberculosisStereochemistryBiologyMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium tuberculosis, the etiological agent of TB, possesses a cholesterol catabolic pathway implicated in pathogenesis. This pathway includes an iron-dependent extradiol dioxygenase, HsaC, that cleaves catechols. Immuno-compromised mice infected with a DeltahsaC mutant of M. tuberculosis H37Rv survived 50% longer than mice infected with the wild-type strain. In guinea pigs, the mutant disseminated more slowly to the spleen, persisted less successfully in the lung, and caused little pathology. These data establish that, while cholesterol metabolism by M. tuberculosis appears to be most important during the chronic stage of infection, it begins much earlier and may contribute to the pathogen's dissemination within the host. Purified HsaC efficiently cleaved the catecholic cholesterol metabolite, DHSA (3,4-dihydroxy-9,10-seconandrost-1,3,5(10)-triene-9,17-dione; k(cat)/K(m) = 14.4+/-0.5 microM(-1) s(-1)), and was inactivated by a halogenated substrate analogue (partition coefficient<50). Remarkably, cholesterol caused loss of viability in the DeltahsaC mutant, consistent with catechol toxicity. Structures of HsaC:DHSA binary complexes at 2.1 A revealed two catechol-binding modes: bidentate binding to the active site iron, as has been reported in similar enzymes, and, unexpectedly, monodentate binding. The position of the bicyclo-alkanone moiety of DHSA was very similar in the two binding modes, suggesting that this interaction is a determinant in the initial substrate-binding event. These data provide insights into the binding of catechols by extradiol dioxygenases and facilitate inhibitor design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,783
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle