Method for the Direct Observation and Quantification of Survival of Bacteria Attached to Negatively or Positively Charged Surfaces in an Aqueous Medium
Notice bibliographique
Résumé
The risk of groundwater contamination by microbial pathogens is linked to their survival in the subsurface. Although there is a large body of literature on the inactivation behavior of suspended (planktonic) microorganisms, little is known about the inactivation of bacteria when attached to sand grain surfaces in groundwater aquifers. The main goal of this study was to develop a fluorescence-based experimental technique for evaluating the extent of inactivation over time of bacteria adhered onto a surface in an aqueous environment. Key features of the developed technique are as follows: (i) attached cells do not need to be removed from the surface of interest for quantification, (ii) bacterial inactivation can be examined in real-time for prolonged time periods, and (iii) the system remains undisturbed (i.e., the aqueous environment is unchanged) during the assay. A negatively or positively charged substrate (i.e., bare or coated glass slide) was mounted in a parallel-plate flow cell, bacteria were allowed to attach onto the substrate, and the loss of bacterial membrane integrity and respiratory activity were investigated as a function of time by fluorescence microscopy using Live/Dead BacLight and BacLight RedoxSensor CTC (5-cyano-2,3-ditolyl tetrazolium chloride) viability assays. These two different measures of bacterial inactivation result in comparable trends in bacterial inactivation, confirming the validity of the experimental technique. The results of this work show that the developed technique is sensitive enough to distinguish between the inactivation kinetics of different representative bacteria attached to either a negatively charged (bare glass) surface or a positively charged (coated glass) surface. Hence, the technique can be used to characterize bacterial inactivation kinetics when attached to environmentally relevant surfaces over a broad range of groundwater chemistries.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».